结核分支杆菌是一种专性需氧菌，因具有独特的细胞壁结构，使其对多种环境压力和消毒剂具有高度抵抗力。该菌主要通过空气传播，当感染者咳嗽、打喷嚏或说话时，含有细菌的飞沫被他人吸入后可能导致感染。结核分支杆菌主要侵犯肺部，如肺结核，但也可播散至其他器官，如肠结核等。临床最简单常见的微生物学检查方法就是涂片抗酸染色。

可从病人咳出的痰液直接涂片，用抗酸染色法染色，浓缩集菌，提高检出率。分枝杆菌的细胞壁含有大量脂质，一般染色法不易着色，一般常用齐-尼抗酸染色，以5%苯酚复红辅以加热方式使细菌着色，用乙醇脱色，再用亚甲蓝复染。结核分枝杆菌可抵抗盐酸酒精的脱色作用而染成红色，其他细菌及细胞染色蓝色。而分枝杆菌仍然为红色，即为抗酸阳性菌。